Studi Molekular Software Pymol untuk Purifikasi dan Isolasi Selektif pada Protein Spike Virus Sars-Cov-2 Varian 7CWM

Authors

  • Fadhila Rahmi Jurusan Kimia, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri Padang
  • Hanifa Shafira1 Fisika, Universitas Andalas, Padang, Indonesia
  • Nadya Gustiranda Cahyeni Teknik Elektro, Universitas Gadjah Mada, Yogyakarta, Indonesia

Keywords:

Spike Sars-Corv-2, Varian 7CWM, Pymol

Abstract

Tujuan riset ini yaitu untuk menganalisis studi molekular software untuk purifikasi dan isolasi selektif pada protein spike virus sars-cov-2 varian 7CWM. Metode yang digunakan adalah pemodelan molekular dengan software pymol versi 2.5.2 dikeluarkan oleh Schrodinger. Aspek kajian dalam riset ini adalah purifikasi dan isolasi selektif. Protein yang dipakai adalah varian spike virus sars-cov-2, yang disiapkan dari pubcheb (website RSCB). Analisis komputasi menggunakan perangkat komputer dengan spesifikasi Cores 4C + 1.80 dengan RAM 8.00 GB . Hasil dari riset ini diperoleh varian yang diisolasi dan dimurnikan adalah spike sars-cov-2 varian 7CWM. Diperoleh protein varian 7CWM yang berbentuk visualisasi remove water dan visualisasi ligan. Pemurnian dan isolasi varian berhasil memisahkan air dan pengotor lain pada protein target.

Downloads

Published

2022-06-13