Pemurnian dan Isolasi Selektif Protein Spike Virus Sars-Cov-2 Varian 7CAB Menggunakan Aplikasi Pymol

Authors

  • Ratna Sari Tuminah Kimia, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri Padang, Padang, Indonesia
  • Devi Tri Lestari Jurusan Matematika, FMIPA, Universitas Asahan (UNA) Kisaran, Indonesia,
  • Syarial Mangunsong Jurusan Pertanian, Fakultas Teknik, Universitas Negeri Medan, Medan, Indonesia

Keywords:

Spike Sars-Cov-2; Varian 7CAB; Pymol

Abstract

Riset ini bertujuan untuk pemurnian dan isolasi selektif protein spike virus sars-cov-2 varian 7cab menggunakan aplikasi pymol. Metode yang digunakan pada riset ini adalah pemodelan molekuler menggunakan aplikasi pymol versi 2.5.2 yang dikeluarkan oleh Schrodinger, LLC. Riset ini memiliki dua kajian yaitu pemurnian dan isolasi selektif. Protein yang dipakai adalah varian spike virus Sars-Cov-2 , yang diperoleh dari website www.pdb.rscb. Analisis komputasi menggunakan perangkat komputer dengan spesifikasi MyBook14E RAM 4,00 GB (3,84 GB usable). Hasil dari riset ini diperoleh varian protein yang diisolasi dan dimurnikan, yaitu protein spike virus sars-cov-2 varian 7CAB. Diperoleh protein varian 7CAB yang berbentuk visualisasi remove waters dan visualisasi ligand. Pemurnian dari isolasi selektif varian 7CAB berhasil memisahkan air dan penotor lain pada protein target.

Downloads

Published

2022-06-13

Issue

Vol. 1 No. 01 (2022): CHEMISTRY SMART

Section

Articles