- Penggunaan Aplikasi PyMol dalam Proyeksi Spike Virus Sars-Cov-2 Varian 7JZN pada Aspek Pemurnian dan Isolasi Selektif

Authors

  • Yana Lendarwati Yana Departemen Kimia, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri Padang, Padang, Indonesia
  • Marzuq Adil.R Program Studi Statistika, Universitas Diponegoro, Semarang, Indonesia
  • Indryani Saputri Program Studi Biologi, Universitas Bengkulu, Indonesia

Keywords:

Pymol, Sars-Cov-2, 7JZN, Pemurnian, Isolasi

Abstract

Riset ini bertujuan untuk mengkaji  penggunakan aplikasi PyMol dalam proyeksi protein spike virus Sars-Cov-2 varian 7JZN pada aspek pemurniaan dan isolasi selektif. Riset ini menggunakan metode studi pemodelan dengan penggunaan aplikasi PyMol versi 2.5.2 Schorodinger. Riset ini memiliki dua kajian yaitu  pemurnian dan isolasi selektif. Protein yang dipakai adalah  varian spike virus Sars-Cov-2 yang disiapkan dan kemudian dipilih dari web online www.ppdb.rscb .Analisis komputasi menggunakan perangkat computer dengan spesifikasi DESKTOP-4M4AR59 dengan RAM 4.00 GB. Hasil yang didapatkan varian yang dimurnikan dan diisolasi adalah spike virus spike Sars-Cov-2 varian 7JZN.Diperoleh protein varian 7JZN yang berbentuk visualisasi remove waters dan visualisasi ligand. Pemurnian dan isolasi selektif varian 7JZN berhasil dipisahkan air dan pengotor lain pada protein target.

Downloads

Published

2022-06-13