- Implementasi Penggunaan Aplikasi PyMol untuk Pemurnian dan Isolasi pada Protein Varian Spike 6ZGH Sars-Cov-2

-

Authors

  • Wiandi Melati Putri Putri Kimia, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri Padang
  • Dyah Anggraeni Ayuningtyas konstruksi Kapal, Teknik Perkapalan, Universitas Diponegoro, Semarang, Indonesia
  • Husnul Amelia Elkhaima Pendidikan Profesi Dokter, Kedokteran, Universitas Andalas, Padang, Indonesia

Keywords:

Protein Spike Virus Sars-Cov-2; Varian 6ZGH; PyMol; Pemurnian; Isolasi Sebagian.

Abstract

Riset ini bertujuan menganalisis implementasikan penggunaan aplikasi PyMol pada pemurnian dan isolasi selektif pada protein varian spike 6ZGH Sars-Cov-2. Metode yang digunakan adalah pemodelan molekul dengan aplikasi PyMol pada pemurnian dan isolasi selektif. Aplikasi PyMol yang digunakan aplikasi PyMol versi 2.5.2 yang dikeluarkan oleh Scodinger. Aspek kajian dalam riset ini adalah pemurnian dan isolasi selektif. Protein yang dipakai adalah protein varian spike virus Sars-Corv-2. Yang disiapkan dari website purchem https://www.rscb.org. Analisis pemodelan molekul ini menggunakan perangkat keras komputer dengan spesifikasi Intel® Celeren® CPU N3350 @ 1.10GHz 1.10GHz, dengan Installed RAM 2,00 GB (1,83 GB usable). Hasil yang didapatkan dari varian yang diisolasi dan dimurnikan adalah protein murni varian spike 6ZGH Sars- Cov-2. Hasil riset ini, diperoleh protein varian 6ZGH yang berbentuk struktur bebas air, ligan natif dan pengotor lain pada protein target.

 

Downloads

Published

2022-06-13

Issue

Vol. 1 No. 01 (2022): MEDICAL-SMART

Section

Articles